水分、pH、全氮、全磷、全鉀、水解氮、有效磷、速效鉀、銨態(tài)氮、氨氮、硝態(tài)氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、全鹽量、水溶性鹽總量、鉀離子、鈣離子、鈉離子、鎂離子、氯離子、硫酸根、碳酸氫根、碳酸根、水溶性和酸溶性硫酸鹽、陽離子交換量、交換性鈣、交換性鎂、交換性鉀、交換性鈉、交換性鹽基總量、鹽基飽和度、有機質(zhì)、有機碳、顆粒組成（機械組成）、微團聚體組成、容重、燒失量、碳酸鈣、鈉、鉀、鉛、鎘、汞、砷、銅、鋅、鎳、鉻、硒、硅、六價鉻、氡、鐵、錳、鈣、鎂、鋁、鋇、鈷、銀、鉬、銻、釩、硼、錳、鐵、銅、有效硫、有效硅、有效硼、有效態(tài)鋅、石油類(礦物油)、硫化物、揮發(fā)酚、氰化物、氟化物、六六六、滴滴涕、苯并（a）芘、揮發(fā)性有機物、半揮發(fā)性有機物、多氯聯(lián)苯、艾氏劑、狄氏劑、異狄氏劑、環(huán)氧七氯、七氯、有機磷農(nóng)藥（速滅磷，甲拌磷，二嗪磷 ，異稻瘟凈，甲基對硫磷 、殺螟硫磷，溴硫磷 ，稻豐散，殺撲磷）

土壤生物學指標：菌落總數(shù)、大腸菌群、大腸桿菌、霉菌、酵母菌等各類常規(guī)微生物、腸桿菌科、 嗜滲酵母、糞鏈球菌、糞大腸菌群、腸桿菌屬等非常規(guī)微生物、微生物量碳、微生物量氮、生物多樣性等、脲酶、過氧化氫酶、磷酸酶、蔗糖酶、纖維素酶、蛋白酶等、有機質(zhì)、胡敏酸、富里酸、腐殖質(zhì)               

土壤污染物指標：各類農(nóng)藥殘留檢測、各類抗生素檢測

土壤營養(yǎng)指標：有機質(zhì)、全氮、速效鉀、速效磷、速效氮、酸堿度、碳氮比、陽離子交換量

土壤代謝組學分析：土壤中各類代謝物分析